Το Ηραίο της Σάμου αποτέλεσε ένα από τα σημαντικότερα ιερά της αρχαίας Ελλάδας. Απέχει 6 χλμ. από την αρχαία πόλη της Σάμου (σημ. Πυθαγόρειο) με την οποία συνδεόταν πολιτικά και διοικητικά. Οι πιστοί έφθαναν στο Ιερό διασχίζοντας την Ιερά Οδό ή από τη θάλασσα. Βρίσκεται στην εύφορη πεδιάδα που σχηματίστηκε από τις προσχώσεις του ποταμού Ίμβρασου. Σύμφωνα με το μύθο στην όχθη του ποταμού κάτω από μια λυγαριά γεννήθηκε η θεά και έτσι θεωρήθηκε ως το ιερό δέντρο της Ήρας. Η ίδρυση του Ιερού στο συγκεκριμένο βαλτώδη χώρο δημιουργούσε διαρκώς προβλήματα στατικής επάρκειας στους ανεγειρόμενους ναούς. Η εμμονή των αρχαίων Σαμίων να χτίζουν πάραυτα τους ναούς προς τιμήν της θεάς Ήρας στην ίδια θέση, οφείλεται στη στενή σχέση της λατρείας της θεάς με το συγκεκριμένο σημείο.